Określoną rolę w regulacji wydzielania soku żołądkowego i czynności motorycznej przewodu pokarmowego odgrywa sekretyna, hormon polipeplydowy, wyodrębniony z błony śluzowej dwunastnicy. Do podstawowych czynności tego hormonu należy hamowanie wydzielania kwaśnego soku żołądkowego oraz hamowanie czynności motorycznej przewodu pokarmowego. Sekretyna pobudza natomiast wydzielanie pepsyny oraz wydzielanie wodorowęglanów i wody przez trzustkę. Działanie to jest prawdopodobnie wynikiem konkurencyjnego blokowania receptora gastryny przez sekretynę. Szeroki zakres działania prostaglandyn (PG) obejmuje również wpływem układ trawienny. Prostaglandyny zostały wykryte także i w przewodzie pokarmowym różnych gatunków zwierząt. Są one silnymi stymulatorami czynności ruchowej przewodu pokarmowego, hamują natomiast wydzielanie kwaśnego soku żołądkowego, niezależnie od rodzaju bodźca. Właściwości takie wykazują PGE, PGE2, PGA2. Dłużej utrzymującym się działaniem odznaczają się dimetylo-PG, uzyskane syntetycznie. Dokładny mechanizm działania PG na czynność wydzielniczą przewodu pokarmowego nie jest jeszcze dobrze poznany. Mogą one hamować tworzenie się cAMP oraz zmniejszać przepływ krwi w błonie śluzowej żołądka. Nie została jeszcze również ściśle określona rola, jaką odgrywać mają PG w przewodzie pokarmowym. Przypuszczalnie jedną z ważniejszych ich czynności jest zapobieganie nadmiernemu wydzielaniu kwaśnego soku żołądkowego.
